MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	CAA	2	6	6	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008765	GTC	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008765	GC	3	6	1124	1129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008765	TC	3	6	1825	1830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008765	TCTG	2	8	1866	1873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008765	GGC	2	6	1917	1922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008765	TGG	2	6	1953	1958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008765	GC	3	6	2002	2007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008765	TGT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008765	TCA	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008765	C	6	6	5180	5185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_008765	GCC	2	6	16251	16256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008765	TCCC	2	8	16926	16933	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008765	TGCG	2	8	16935	16942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008765	GCA	2	6	16971	16976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008765	AGCG	2	8	16995	17002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008765	GC	3	6	17030	17035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008765	CCT	2	6	20727	20732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008765	GTTG	2	8	21093	21100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008765	A	6	6	22115	22120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008765	CCG	2	6	22202	22207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008765	CACC	2	8	22426	22433	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008765	AG	3	6	24391	24396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008765	A	7	7	24402	24408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008765	GGTC	2	8	25374	25381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008765	TCG	2	6	25424	25429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008765	CAT	2	6	25438	25443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008765	CGG	2	6	25484	25489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008765	GGTC	2	8	25557	25564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008765	TCA	2	6	25594	25599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008765	CA	3	6	25598	25603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008765	GCC	2	6	25643	25648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008765	CG	4	8	25655	25662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008765	GC	3	6	25680	25685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008765	CGC	2	6	31481	31486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008765	GC	3	6	31517	31522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008765	GTG	2	6	31558	31563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008765	TG	3	6	31562	31567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008765	TTC	2	6	31572	31577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008765	GAA	2	6	31606	31611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008765	GCA	2	6	31684	31689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008765	CCCG	2	8	31693	31700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_008765	CAGG	2	8	31703	31710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008765	CTT	2	6	32161	32166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008765	GA	3	6	32226	32231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008765	GC	3	6	32249	32254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008765	GGTTT	2	10	32294	32303	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008765	CAG	2	6	32330	32335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008765	AAG	2	6	32430	32435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008765	GCA	2	6	32554	32559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008765	GGC	2	6	32956	32961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008765	GAAG	2	8	32966	32973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008765	CAG	2	6	33033	33038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008765	GCA	2	6	33072	33077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008765	GCC	2	6	33089	33094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008765	GCC	2	6	33163	33168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008765	GGC	2	6	33173	33178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008765	GGC	2	6	33226	33231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008765	AGC	2	6	33242	33247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008765	CGGC	2	8	33310	33317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008765	GGC	2	6	33350	33355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008765	TGG	2	6	33369	33374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008765	AGCGG	2	10	33409	33418	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008765	GAA	2	6	33460	33465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008765	GGCCG	2	10	33493	33502	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008765	CGG	2	6	33509	33514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008765	GGTA	2	8	35073	35080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008765	CAG	2	6	35225	35230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008765	CGCAG	2	10	35780	35789	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_008765	GC	3	6	35833	35838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008765	GAAC	2	8	35854	35861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008765	CAC	2	6	35902	35907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008765	CG	4	8	35936	35943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008765	GCA	2	6	36010	36015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008765	AGC	2	6	36053	36058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008765	CAG	2	6	36090	36095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008765	GGAG	2	8	36121	36128	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008765	CCAG	3	12	36152	36163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008765	CAG	3	9	36161	36169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008765	AAGG	2	8	36176	36183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008765	GC	4	8	36198	36205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008765	GC	3	6	36207	36212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008765	CAGC	2	8	36226	36233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008765	GCCCT	2	10	36242	36251	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_008765	GCC	2	6	36522	36527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008765	CG	3	6	36538	36543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008765	GCC	2	6	36998	37003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008765	GCGT	2	8	37515	37522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008765	TGG	2	6	37523	37528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008765	GTCTG	2	10	39555	39564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008765	TCA	2	6	39594	39599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008765	GA	3	6	39653	39658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008765	A	6	6	39658	39663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008765	TTC	2	6	39695	39700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008765	CGGGG	2	10	39729	39738	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008765	GGCC	2	8	39845	39852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008765	CCA	2	6	39861	39866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008765	TCG	2	6	39873	39878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008765	CAGCG	2	10	39980	39989	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008765	CCGG	2	8	40008	40015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008765	GAC	2	6	40026	40031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008765	GTG	2	6	40050	40055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008765	CG	3	6	40067	40072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008765	CAC	2	6	40101	40106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008765	CG	4	8	40132	40139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008765	GC	3	6	40178	40183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008765	CGC	2	6	40235	40240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008765	GGC	2	6	40242	40247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008765	ACG	2	6	40293	40298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008765	GCCCT	2	10	40329	40338	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_008765	CATGC	2	10	40401	40410	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008765	GC	3	6	40483	40488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008765	CAG	2	6	40537	40542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008765	CG	3	6	40548	40553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008765	GCCC	2	8	40575	40582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_008765	GGCG	2	8	40588	40595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008765	CG	3	6	40870	40875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008765	CGGC	2	8	40923	40930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008765	GGGA	2	8	41645	41652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008765	CG	3	6	41661	41666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008765	GGC	2	6	41680	41685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008765	TGA	2	6	42535	42540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008765	GC	3	6	42564	42569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008765	TGG	2	6	43064	43069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008765	TGC	2	6	43074	43079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008765	GA	3	6	43157	43162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008765	A	6	6	43162	43167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008765	TTC	2	6	43199	43204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008765	CGGGG	2	10	43233	43242	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008765	GGCC	2	8	43349	43356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008765	CCA	2	6	43365	43370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008765	TCG	2	6	43377	43382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008765	CAGCG	2	10	43484	43493	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008765	CCGG	2	8	43512	43519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008765	GAC	2	6	43530	43535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008765	GTG	2	6	43554	43559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008765	CG	3	6	43571	43576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008765	CAC	2	6	43605	43610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008765	CG	4	8	43636	43643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008765	GC	3	6	43682	43687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008765	CGC	2	6	43739	43744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_008765	GGC	2	6	43746	43751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008765	GTCTG	2	10	46198	46207	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008765	TCA	2	6	46237	46242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008765	CG	3	6	46294	46299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008765	CG	4	8	46348	46355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008765	TGT	3	9	48836	48844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008765	TGT	2	6	48846	48851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008765	A	6	6	48862	48867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008765	CAA	2	6	48868	48873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008765	GC	3	6	48921	48926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008765	GC	3	6	48968	48973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008765	CGGC	2	8	48990	48997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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155	NC_008765	CGG	2	6	49063	49068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_008765	TG	3	6	49149	49154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_008765	CGG	2	6	49692	49697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_008765	G	6	6	49796	49801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
176	NC_008765	GGA	2	6	49805	49810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_008765	G	7	7	49840	49846	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
179	NC_008765	C	6	6	49849	49854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
180	NC_008765	CGG	2	6	49857	49862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_008765	CG	5	10	49894	49903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_008765	GGAC	2	8	49916	49923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
183	NC_008765	T	6	6	49950	49955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_008765	CCG	2	6	50050	50055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_008765	T	6	6	50056	50061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008765	GCA	2	6	50120	50125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_008765	A	6	6	50125	50130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_008765	TCCC	2	8	50289	50296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
189	NC_008765	GAC	2	6	50313	50318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_008765	CTGT	2	8	51314	51321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
191	NC_008765	CTT	2	6	51379	51384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_008765	GGC	2	6	52633	52638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_008765	GCC	2	6	52644	52649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
196	NC_008765	TCGT	2	8	54752	54759	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
197	NC_008765	TGG	2	6	55223	55228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
198	NC_008765	GTT	2	6	55292	55297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.